2026年6月,中国科学院化学研究所研究团队在《德国应用化学》(Angewandte Chemie)发表STePTag技术,首次将邻近生物素标记(Proximity Labeling)从细胞水平跃升至活体器官水平。这项突破意味着,研究者无需转基因动物,即可在生理条件下解析靶器官的分泌蛋白质组——对蛋白质组学研究而言,这是方法论层面的一次重要跨越。
一、邻近标记技术的三代演进
邻近标记的核心思想是:将生物素连接酶或过氧化物酶融合到目标蛋白上,对酶周围一定半径内的蛋白质进行生物素化标记,再借助链霉亲和素富集与质谱鉴定,绘制蛋白质相互作用网络。
| 技术代际 | 代表工具 | 标记时间 | 标记半径 | 主要局限 |
|---|---|---|---|---|
| 第一代 | BioID(BirA*) | 18–24小时 | 约10 nm | 速度慢,难捕捉动态过程 |
| 第二代 | TurboID | 10–30分钟 | 约10 nm | 本底活性较高 |
| 互补路线 | APEX2 | 约1分钟 | 约20 nm | 需H₂O₂,可能引起氧化应激 |
| 2026新突破 | STePTag | 30分钟 | —— | 首次实现活体器官水平 |

TurboID通过定向进化改造BirA,将标记速度提升约15倍;而APEX2走的是另一条路线——工程化抗坏血酸过氧化物酶,在H₂O₂存在下将生物素-酚氧化为短寿命自由基,实现分钟级标记。此外,Split-TurboID(条件性标记PPI)和UltraID(仅19 kDa,分子量更小)等新一代工具也在2026年的研究中被广泛应用。
二、STePTag:开关化TurboID + LNP递送
STePTag的技术设计可以概括为"开关化"与"递送"两步:
融合构建:将TurboID与大肠杆菌二氢叶酸还原酶(DHFR)融合。无配体时DHFR不稳定,融合蛋白被降解;加入甲氧苄啶(TMP)后,DHFR稳定化并激活TurboID活性。
LNP递送:利用脂质纳米颗粒将STePTag的mRNA递送至小鼠肝脏,无需构建转基因动物。
快速标记:注射生物素底物后,30分钟内完成肝脏分泌蛋白的原位生物素化。
借助该平台结合蛋白质组学分析,团队在生理条件下鉴定出93种肝脏来源分泌蛋白,并在急性肝损伤模型中捕获了40种动态变化的分泌蛋白,解析了醛脱氢酶分泌在药物性肝损伤中的保护作用机制。
三、对实验室研究的启示
邻近标记技术的持续进化,直接推高了对高质量生物素化试剂与探针的需求——从生物素-酚(BP)、生物素-酚酰胺等APEX底物,到各类生物素化连接子与标记砌块,试剂的纯度与批次一致性直接影响标记本底和数据可信度。
值得注意的是,2025年9月北京生命科学研究所与北京脑科学研究所合作的LINCS技术(Neuron,Cell子刊封面)利用seTurboID实现了沿长轴突神经元的完整生物素标记覆盖,进一步说明这一技术家族正在向更精细的组织与细胞类型扩展。
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