产品概述
生物素标记Niraparib(Biotin-Niraparib) 是在PARP抑制剂尼拉帕利分子上引入生物素标签的功能性探针。尼拉帕利(Niraparib, Zejula®)是第三代PARP1/2抑制剂,通过捕获PARP酶于DNA损伤位点产生"合成致死"效应,临床获批用于卵巢癌、输卵管癌和原发性腹膜癌的维持治疗。生物素标记版本在保留PARP催化抑制和DNA-PARP trapping能力的同时,引入了亲和富集功能,为PARP靶点engagement验证、耐药机制研究和新型生物标志物发现提供了直接可用的化学工具。
标记策略与技术特点
分子设计考量
Niraparib的核心药效团为吲哚酮骨架,通过氢键与PARP催化中心的甘氨酸残基结合。标记位点设计遵循以下原则:
位点选择:在Niraparib分子的哌啶侧链远端进行修饰,该位点远离PARP催化结合口袋,对抑制活性影响极小
连接臂设计:采用PEG4柔性连接臂(约20 Å),确保生物素标签不会干扰药物与PARP酶的结合,同时便于链霉亲和素磁珠的接近和富集
活性保留:标记后产物对PARP1的IC50偏移控制在3倍以内(相对于游离Niraparib),确保探针的生物学相关性
质控标准
| 检测项目 | 方法 | 标准 |
|---|---|---|
| 结构确证 | LC-MS, ¹H-NMR | 与理论分子量一致,结构正确 |
| 纯度 | HPLC (UV 254 nm) | ≥95% |
| 游离生物素 | HPLC | <1% |
| 标记比 | LC-MS | 1:1(单标记) |
| 活性验证 | PARP1酶活抑制实验 | IC50偏移<3倍 |
核心应用场景
应用一:PARP靶点亲和富集与蛋白组学
生物素标记Niraparib可作为"诱饵"探针,从细胞裂解液中富集PARP1/2及其相互作用蛋白:
靶点验证:将探针与细胞裂解液孵育,链霉亲和素磁珠富集后Western Blot检测PARP1/2
相互作用组分析:LC-MS/MS鉴定PARP复合物的新组分,揭示DNA损伤修复网络的组成
竞争实验:用游离Niraparib竞争,区分特异性靶点与非特异性结合蛋白
应用二:耐药机制研究
PARP抑制剂耐药是临床面临的重大挑战,常见机制包括PARP1突变、药物外排增加、同源重组修复恢复等。生物素标记Niraparib可用于:
结合力评估:比较野生型和耐药突变型PARP1与探针的结合能力差异
细胞摄取分析:结合荧光标记链霉亲和素,定量分析敏感株和耐药株的药物摄取差异
靶点表达动态:在DNA损伤诱导不同时间点,pull-down评估PARP1的表达和修饰状态变化
应用三:DNA损伤修复通路研究
PARP抑制剂通过trapping PARP于DNA损伤位点发挥作用。生物素标记探针可用于:
DNA-PARP复合物富集:从染色质组分中富集被trapped的PARP-DNA复合物
损伤位点定位:结合ChIP-seq策略,在全基因组水平定位PARP trapping位点
修复动力学研究:时间梯度pull-down,追踪DNA损伤修复过程中PARP的动态变化
产品优势
| 维度 | 优势说明 |
|---|---|
| 活性保留 | IC50偏移<3倍,生物学相关性高 |
| 位点精准 | 哌啶侧链远端标记,不干扰药效团 |
| 富集效率 | PEG4连接臂优化,pull-down信噪比高 |
| 质控严格 | 酶活验证+结构确证双重保障 |
| 技术支持 | 提供完整pull-down和CETSA实验方案 |
技术参数
| 参数 | 规格 |
|---|---|
| 产品名称 | Biotin-Niraparib |
| 外观 | 白色至类白色固体 |
| 纯度 | ≥95%(HPLC) |
| 溶解性 | 溶于DMSO(10 mM储存液) |
| 保存条件 | -20°C避光干燥 |
| 保质期 | 12个月 |
| 运输条件 | 冰袋或干冰运输 |
使用建议
储存液:无水DMSO配制10 mM储存液,分装避免冻融
Pull-down浓度:1-5 μM,孵育30-60 min(4°C)
对照:设置10倍过量游离Niraparib竞争对照
洗涤:建议高盐洗涤(300-500 mM NaCl)降低非特异性结合
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