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生物素修饰舒尼替尼:多靶点激酶抑制剂的化学蛋白质组学探针

产品概述

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生物素修饰舒尼替尼(Biotin-Sunitinib) 是在舒尼替尼分子结构基础上引入生物素标签的衍生物。舒尼替尼(Sunitinib, Sutent®)是全球首个获批的多靶点受体酪氨酸激酶(RTK)抑制剂,可同时靶向VEGFR1-3、PDGFRα/β、c-KIT、FLT3、RET和CSF1R等多个激酶,临床用于治疗晚期肾细胞癌、胃肠道间质瘤(GIST)和胰腺神经内分泌肿瘤。通过在舒尼替尼分子上精准引入生物素标签,这一探针分子保留了母药的多激酶结合能力,同时赋予其通过链霉亲和素体系进行富集、检测和追踪的功能,成为激酶靶点验证和化学蛋白质组学研究的得力工具。


标记策略与技术特点

标记位点设计

舒尼替尼分子的吲哚酮核心是与激酶ATP结合口袋结合的关键药效团,标记位点的选择必须避开该区域以保持结合活性。纳孚生物采用以下策略:

  • 连接位点:在舒尼替尼分子的二乙氨基侧链末端进行修饰,该位点远离激酶结合口袋,对结合亲和力影响最小

  • 连接臂选择:采用PEG4或C6连接臂,提供适当的柔性和亲水性,减少空间位阻,同时避免疏水性增加导致的非特异性结合

  • 标记比控制:确保每个舒尼替尼分子连接一个生物素标签,标记比≈1:1,保证批次间一致性

结构确证

每批次产品均经过LC-MS和¹H-NMR确证,确保标记位点和产物结构正确。纯度≥95%(HPLC),游离生物素残留<1%。

核心应用场景

应用一:激酶靶点亲和富集与鉴定

生物素修饰舒尼替尼保留了与VEGFR、PDGFR、c-KIT等靶激酶的结合能力,可用于:

  1. 靶点Pull-down:将探针与细胞裂解液孵育,通过链霉亲和素磁珠富集与舒尼替尼直接结合的激酶,经LC-MS/MS鉴定

  2. 竞争性结合实验:用过量未标记舒尼替尼竞争,排除非特异性结合蛋白,提高靶点鉴定可信度

  3. 脱靶效应研究:系统鉴定舒尼替尼的全激酶组作用谱,评估潜在脱靶风险

应用二:药物-靶点engagement验证

通过CETSA(细胞热位移分析)结合生物素探针pull-down,在活细胞水平验证舒尼替尼与靶激酶的直接结合:

  • 评估不同浓度下的靶点engagement程度

  • 比较野生型和突变型激酶的结合差异

  • 研究耐药机制(如c-KIT二级突变对结合的影响)

应用三:药物亚细胞分布追踪

利用生物素-链霉亲和素的高亲和力(Kd≈10⁻¹⁵ M),结合荧光标记链霉亲和素,可在细胞水平追踪舒尼替尼的摄取和亚细胞分布:

  • 共聚焦显微镜观察药物在细胞内的定位

  • 流式细胞术定量分析药物摄取动力学

  • 与溶酶体/线粒体等细胞器标志物共定位分析

产品优势

维度纳孚生物产品特点
标记位点远离药效团,保留激酶结合活性
连接臂PEG4亲水连接臂,减少非特异性吸附
纯度HPLC ≥95%,游离生物素<1%
结构确证LC-MS + ¹H-NMR双重确证
批次一致性严格SOP,标记比1:1可控
应用支持提供Pull-down实验方案技术支持

技术参数

参数规格
产品名称Biotin-Sunitinib
外观黄色至橙黄色固体
纯度≥95%(HPLC)
分子量根据具体连接臂确定
溶解性溶于DMSO(10 mM储存液)
保存条件-20°C避光干燥
保质期12个月

使用建议

  1. 储存液配制:用无水DMSO配制10 mM储存液,分装后-20°C避光保存

  2. 工作浓度:Pull-down实验建议1-10 μM;CETSA建议0.1-1 μM

  3. 对照设置:建议同时使用未标记舒尼替尼进行竞争实验,排除非特异性结合

  4. 注意事项:避免反复冻融;DMSO储存液建议3个月内使用

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