live chat
live chat
网站首页/有机动态/有机干货/光亲和标记(PAL)原理:双吖丙啶如何精准捕获药物靶标
光亲和标记(PAL)原理:双吖丙啶如何精准捕获药物靶标

药物靶标发现的挑战

现代药物研发中,确认小分子药物的直接作用靶标是理解药物机制、优化先导化合物、评估脱靶毒性的核心环节。然而,传统蛋白质互作研究方法(免疫共沉淀、酵母双杂交等)难以捕捉弱亲和力、瞬时性的药物-靶标相互作用。

光亲和标记(Photoaffinity Labeling, PAL)技术正是为解决这一挑战而生——它在药物结合后通过紫外光照射,将瞬时的非共价相互作用"锁定"为永久共价键,为下游靶标鉴定提供可靠的分子探针。

image-02-PAL-principle


双吖丙啶(Diazirine):PAL的核心光反应基团

光反应基团是PAL探针的"引爆器"。目前最主流的三类光反应基团对比如下:

光反应基团激活波长中间体反应选择性化学稳定性
二苯甲酮(Benzophenone)365 nm三线态氧较低(偏好C-H)
芳基叠氮(Aryl Azide)265–290 nm氮宾较低,副反应多
双吖丙啶(Diazirine)350–380 nm卡宾高(C-H、N-H、O-H均可)

双吖丙啶的四大优势:

  1. 激活波长温和(≈365 nm):对生物分子损伤极小,可用于活细胞及蛋白质环境

  2. 卡宾活性极高:生成的单线态卡宾半衰期极短(纳秒级),高度反应性,可与几乎所有有机官能团成键

  3. 体积微小(MW ≈ 42 Da):对母体药物的药代动力学影响最小

  4. 化学稳定性好:室温、避光条件下可长期储存,不影响合成操作


PAL探针的"三件套"设计

一个完整的PAL探针分子通常包含三个功能模块:

[结合模块] — [连接臂] — [光反应基团] + [报告基团]
   ↓               ↓           ↓              ↓
药物母体        PEG/烷链     双吖丙啶      生物素/炔基
(识别靶标)   (空间调控)  (光交联固定)  (富集与检测)
  • 结合模块:保留药物与靶蛋白的结合能力,是探针活性的基础

  • 连接臂:调节光反应基团与结合位点的距离,兼顾灵活性与交联效率

  • 光反应基团(双吖丙啶):光照后产生卡宾,与靶蛋白形成共价键

  • 报告基团:生物素用于链霉亲和素富集;炔基用于点击化学后标记


实验工作流程

标准PAL-LC-MS/MS靶标发现流程:

  1. 探针孵育:PAL探针与细胞裂解液或活细胞共孵育,使探针与靶蛋白非共价结合

  2. UV光照(365 nm,10–30 min):触发双吖丙啶光交联,形成共价复合物

  3. 蛋白质变性裂解:打破非特异性相互作用,保留共价交联产物

  4. 生物素富集:链霉亲和素磁珠捕获生物素标记的探针-蛋白复合物

  5. 酶切鉴定:胰蛋白酶酶切后,LC-MS/MS鉴定靶蛋白及交联肽段


纳孚生物光交联探针产品

纳孚生物已开发四款双吖丙啶修饰光交联探针,直接覆盖当前热门科研方向:

产品母体药物研究方向
双吖丙啶-沃替西汀抗抑郁药Vortioxetine抑郁症靶标机制研究
双吖丙啶-青蒿素B抗疟/抗癌天然产物青蒿素多靶标发现
双吖丙啶-夫西地酸抗菌药Fusidic Acid抗菌药物耐药机制
双吖丙啶-茉莉酸植物激素Jasmonic Acid植物信号通路研究

专属定制:如需针对您的先导化合物设计PAL探针,纳孚生物提供全流程定制合成服务。


联系我们

纳孚生物 — 专业化合物定制合成与生物素标记服务商

联系方式详情
电话021-58952328
Q Q3599547900 ;2087788560
邮箱sale@chemhui.com / info@chemhui.com
网址www.nayuansu.com



纳孚服务
  • 化学试剂
  • 提供稀有化学试剂现货

  • 化学试剂定制合成服务
  • 上海纳孚生物科技有限公司提供市场稀缺的化学试剂定制服务

  • 新材料现货
  • 上海纳孚生物科技有限公司代理或自产包含石墨烯产品,类石墨烯产品、碳纳米管、无机纳米材料以及一些高分子聚合物材料

  • 结构设计及定制合成
  • 可以根据客户需求对所需化合物结构进行设计改性,从而定制合成出客户所需分子式结构

  • 联系我们
  • 021-58952328
  • 13125124762
  • info@chemhui.com
  • 关注我们
在线客服
live chat