分享一篇发表在ACS Chemical Biology上的文章，题目为“Chemokine-Binding All-D-CLIPS Peptides Identified Using Mirror-Image Phage Display”，通讯作者是来自维也纳大学的Stepan S. Denisov教授。这篇文章利用镜像噬菌体展示方法筛选到一条与趋化因子结合的全D型手性环肽。

趋化因子是一种分泌性血液蛋白，可以介导炎症反应中的白细胞迁移。开发趋化因子的结合剂是一种潜在的治疗策略。由于趋化因子表面缺乏深层结合口袋，因此开发小分子配体具有一定挑战。目前，研究者已经开发了一些多肽结合剂，但它们的代谢稳定性差，极大地阻碍了治疗应用。D型肽可以保护肽键免受蛋白水解，因此作者设想开发D肽作为趋化因子结合剂可能是一种优越的方法。

为了进行筛选，需要在L肽化学空间中寻找与D型蛋白结合的序列，然后合成D型对映体。本文首先化学合成了趋化因子配体8CXC基序（CXCL8）的D型蛋白。然后使用具有十个随机氨基酸区域的肽噬菌体文库进行筛选，化学空间为3.4E+9。此外，他们通过环化限制构象灵活性，增加结合亲和力。作者之后将合成的D-CXCL8-Biotin固定在链霉亲和素珠上，然后与噬菌体文库共孵育，进行三轮筛选，之后进行测序得到五百余种初始候选肽，进行聚类分析并研究簇内保守基序，得到95种候选肽。对这些候选肽进行固相合成，然后使用SPR分析其与D-CXCL8的结合，最终找到4种肽，结合力达到亚微摩尔水平。

作者最后使用核磁波谱对D肽的结合机制进行解析，结果表明D肽可以诱导天然趋化因子二聚体解离，破坏其与GAG结合，但不影响体外的细胞迁移。

本文作者：WYJ

责任编辑：LYC

DOI：10.1021/acschembio.5c00726

原文链接：https://doi.org/10.1021/acschembio.5c00726