分享一篇发表在JACS上的文章,题目为“Light-Induced, Lysine-Targeting Irreversible Covalent Inhibition of the Human Oxygen Sensing Hydroxylase Factor Inhibiting HIF (FIH)”,通讯作者是来自中国药科大学的张晓进教授,他主要研究细胞氧感知通路和氧化还原系统;以及牛津大学的Christopher J. Schofield教授,他们主要研究加氧酶。这篇文章中作者报道了光诱导的靶向FIH蛋白Lys106位的共价抑制剂的开发。
细胞氧稳态是调节氧气供应和消耗之间平衡的基本生理机制。HIF是调节氧稳态的重要蛋白,因此对它们进行调控是重要的。HIF的转录激活受到加氧羟化酶FIH的抑制,在这篇文章中,作者针对FIH报道了一种具有选择性的光控共价抑制剂。光控共价抑制剂可以帮助研究转录的时间依赖性,因此具有重要的意义。
作者首先观察了已知的FIH抑制剂ZG-2291与蛋白结合的共晶结构。该抑制剂结合FIH的Tyr102位,使FIH活性位点构象翻转。作者发现在这种结合状态下,ZG-2291与附近具有柔性侧链的Lys106位发生相互作用,这启发他们开发靶向Lys106的FIH共价抑制剂。
作者希望利用伯胺和邻硝基苄醇(o-NBA)之间的光诱导环化点击反应,证明NBA-ZG-2291在光激活后与FIH共价反应,导致FIH催化的羟基化有效失活,从而能够对照研究FIH在氧感应和其他途径中的作用。
作者首先在小分子水平证明了NBA-ZG-2291和带保护基的赖氨酸可以在光激活下发生反应,2 h后反应饱和,产率约90%。
在蛋白质水平上进行测试,也发现NBA-ZG-2291和FIH反应后可以产生共价加合物。
在分子动力学模拟结果中,可以看到抑制剂的确与Lys106发生共价反应,使Lys106的柔性侧链被固定。测试结合亲和力,发现在无光照时,Ki为423nM,光照稳定后,Ki为40nM.
作者测试了抑制剂对FIH酶活的抑制能力,发现NBA-ZG-2291比ZG-2291有更强的抑制效果。
作者测试了NBA-ZG-2291对FIH的选择性。他们选择FIH的类似功能酶及底物HIF进行CETSA测定,结果发现只有FIH有明显的热移,其余蛋白无明显变化,说明NBA-ZG-2291对FIH有较好的选择性。
作者对FIH的靶蛋白EGLN3进行了分析。FIH可以抑制该蛋白表达,加入NBA-ZG-2291抑制剂后,EGLN3表达上调。但FIH被敲除后则没有该效果。
总之,这篇文章开发了FIH酶的光激活共价抑制剂,可以调控HIF等蛋白,对细胞内氧化还原情况进行调控。
本文作者:WYJ
责任编辑:WYQ
DOI:10.1021/jacs.5c01935
原文链接:https://doi.org/10.1021/jacs.5c01935