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诺丁汉大学Nat Catal | 酰基转移酶三联体突变实现硫酯合成并拓展底物反应谱

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摘要

生物催化的主要目标之一是扩展有机化学家可利用的酶促反应工具箱。本文酰基转移酶催化三联体S11C突变扩展了其合成能力,能够有效催化硫酯和叔酰胺的合成。 使用乙烯基酯作为酰化剂,以不同的硫醇和仲胺作为合成砌块进行了制备规模(250 mM)的生物转化,转化率极高,并已成功应用于乙酰辅酶A及其类似物的合成。




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内容

硫酯在酰基转移反应中作为重要的反应供体,酰胺键是许多药物的关键官能团,目前尚无合适的硫代酯和叔酰胺生物催化合成方法。MsAcT(来源于耻垢分枝杆菌)SGNH丝氨酸水解酶超家族具有共同的特征,其中包括催化三联体(Ser-His-Asp),该三联体在进化上十分保守。在典型的酰基转移酶机理中,催化三联体促使形成酰基酶中间体(acyl-O-Ser-enzyme),该中间体对于亲核试剂反应性较弱。将催化氨基酸丝氨酸突变为半胱氨酸将产生更具反应性的acyl-S-Cys-enzyme,不仅有助于通过Cys-S-消除,而且可以通过氧阴离子穴中的氢键来实现。但是,这种丝氨酸水解酶催化三联体中的Ser / Cys交换大大降低水解其活性。本文作者将酰基转移酶的催化氨基酸Ser突变为Cys以扩大其在水性介质中的合成能力。 S11C突变体表现出对巯基以及仲胺更宽泛的底物范围。以一种绿色的方式合成硫酯和叔酰胺,例如可以合成乙酰辅酶A(乙酰辅酶A)及其类似物。

硫酯的合成。使用2-苯基乙硫醇(1a)作为模式底物,通过探查S11C MsAcT底物范围进一步建立了由S11C MsAcT催化的硫酯合成(1)。


 

与野生型不同,S11C MsAcT不接受乙酸乙酯作为酰基供体,因为它未充分活化。用两种选定的硫醇(1a1b)进一步研究了对不同乙烯基酯供体的反应性(2)。

 


辅酶A类似物N-乙酰半胱胺(HS-NA , 1o)可用来合成辅酶A硫酯(1)。

 


Fig. 1 | Biosynthesis of acetyl-CoA and its mimetics.
 

通过计算研究深入了解乙酰辅酶A及其模拟物的结合,当硫酯羰基氧在距Cys11的催化距离处指向氧阴离子孔时,乙酰辅酶A显示出最佳分数(2)。

 

Fig. 2 | Docking of acetyl-CoA.
 

为研究辅酶A向活性位点的转运以及乙酰辅酶A沿相反方向的出口,使用CaverDock软件计算底物在其到达活性腔的路径中的能量分布(3)以及在相反方向上的产物。CoA倾向于腺嘌呤首先进入活性腔,从而最终观察到结构的翻转。

 

Fig. 3 | CoA and acetyl-CoA computational studies.

 

叔酰胺的合成。使用乙酸乙烯酯作为供体测试了一系列仲胺和环胺(250mM)(3),证明了S11C MsAcT的多功能性。

 


MsAcT S11C的立体选择性。野生型 MsAcT对选定的底物仅表现出中等的对映选择性。因此,使用乙酸乙烯酯作为供体,使用支链亲核试剂(表41-7)和α-取代的环状仲胺(表48-10)评估MsAcT S11C4)。

 


总而言之,本项研究打破了酶工程学的规则开发出一种新的化学反应方法。为了改变酶的底物范围,突变通常是涉及底物识别中的关键残基,无论是通过合理的设计还是通过定向进化,始终保持催化残基不变。本文酰基转移酶催化三联体S11C突变能够转化野生型无法接受的底物类型并用来合成叔酰胺和硫酯,可以在温和的条件下合成具有挑战性的分子(如乙酰辅酶A)实现大规模转化,最终实现模拟细胞代谢。



来源:遇见生物


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